Karakteristik Polifasik Bakteri Amilolitik Penyebab Kemasan Pada Tepung Sagu Basah

Bakteri amilolitik penyebab kemasaman yang didapat dari tepung sagu basah dalam tatanan klasifikasi bakteri amilolitik di dunia masih belum jelas kedudukannya, oleh karena itu perlu dilakukan karakterisasi. Karakterisasi perlu data yang lengkap, secara polifasik melibatkan proses identifikasi secara numerik, kemotaksonomi dan molekular akan menghasilkan data yang lengkap dan akurat untuk mendudukkan isolat bakteri amilolitik terpilih dalam tatanan klasifikası bakteri secara benar dan tak terbantahkar.
Identifikasi numerik dilakukan pertama kali dengan menentukan generic assignment ketiga isolat selanjutnya dilakukan uji biokimia menggunakan API50CH, karakter yang didapat dianalisisis menggunakan program MVSP87 hasil akhir berupa dendrogram Sedangkan identifikasi dengan pendekatan kemotaksonomi dilakukan dengan menganalisa profil protein setiap isolat dibandingkan type strain acuan, band yang terlihat kemudian dibandingkan. Sedangkan identifikasi secara molekular dilakukan dengan menganalisa sequence 16SrDNA setiap isolat dibandingkan dengan sequence yang didapat dari genbank da abase of NCBI.
Karakterisasi secara polifasik baik secara numerik, kemotaksonomi maupun berdasarkan analisis sekuen gen 16SrDNA terhadap isolat bakteri amilolitik strain TG12,TG19 dan TG31, mengklasifikasikan ketiga isolat pada genus Bacillus. Isolat strain TG12 dan TG19 memiliki similaritas genetik dengan strain acuan Bacillus substilis strain 1767 dan secara fenetik mirip dengan type strain Bacillus susbstilis ATCC 6051, sedangkan isolat strain TG31 memiliki similaritas genetis dengan Bacillus cereus strain ATCC 10987T, dan secara fenetik mirip dengan Bacillus cereus ATCC 14579